据海关总署统计，前三季度全国自贸试验区进出口总值达6.09万亿元，同比增长11.99%。其中，出口2.74万亿元，同比增长16.10%；进口3.35万亿元，同比增长8.83%。
海关总署完善海关监管创新模式制度体系，倡导基层首创与顶层设计相结合，指导各自由贸易试验区海关全面落实总体方案任务要求，大胆试、大胆闯、自主改，积极探索，勇于创新，形成了一批标志性、引领性制度创新成果。截至目前，在国务院发布的7批162项改革试点经验中，海关贡献了62项，占总数的38.3%。
为充分发挥各类区域制度优势，海关总署积极推动海关特殊监管区域与自贸试验区统筹发展。支持在自贸试验区内设立综合保税区，通过综合保税区政策优势为自贸试验区搭建更好的创新平台，目前22个自贸试验区内共有71个海关特殊监管区域，实现了自贸试验区内海关特殊区域全覆盖。加大力度推进自贸试验区与综合保税区创新联动，支持自贸试验区内的综合保税区扩大全球维修产品目录，允许自贸试验区内的综合保税区企业开展本集团国内自产产品的维修，不受维修产品目录限制，进一步推动两区联动发展。
各自贸试验区海关因地制宜开展海关监管制度创新工作，加强协同创新，激发自贸活力。厦门海关创新航空维修系列海关监管模式，支持福建自贸试验区厦门片区建成“一站式”航空维修基地。2024年前三季度，厦门海关共监管进境维修飞机152架次，保税维修货值1215.14亿元，维修飞机数量和货值稳居全国第一，业务覆盖亚美欧24个国家和地区。据统计，福建自贸试验区厦门片区海关注册备案企业数，已由2015年设立初期的3000余家增长至2024年的12340家，增长超过3倍。2024年前三季度，厦门片区进出口值3648.2亿元，占厦门市进出口值的38.52%，占福建自贸试验区进出口值的80.9%。
天津海关积极探索保税租赁监管新模式，助力天津自贸试验区成为继爱尔兰之后全球第二大飞机保税租赁聚集地，2024年前三季度，监管进出口租赁货值671.28亿元，同比增长5.59%。杭州海关深化“一船多供”“跨关区直供”等监管制度集成创新，启动全国首个保税燃料油跨关区直供无纸化试点，助力舟山港跻身全球第四大加油港，2024年前三季度保税供油506.1万吨。
